Protezione del paziente da germi infettivi durante gli esami o le operazioni e, inoltre, in determinate situazioni, protezione di chi lo indossa da spruzzi di liquidi potenzialmente contaminati.
In situazioni particolari, ad esempio in caso di epidemie o pandemie, la mascherina medica può essere indossata anche dai pazienti e da altre persone per ridurre il rischio.